南京“双一流”高校毕业生在上海落户，并非直接因毕业院校而自动获得资格，而是需符合上海市针对应届高校毕业生的落户政策。目前，上海对“双一流”建设高校及学科的应届毕业生有较为宽松的落户支持政策。

根据上海市最新发布的《2023年非上海生源应届普通高校毕业生进沪就业申请本市户籍办法》（通常每年更新），符合条件的“双一流”高校应届毕业生可直接申请落户，无需评分。具体条件如下：

1. 毕业院校要求：申请人须为“双一流”建设高校或“双一流”建设学科的全日制应届本科及以上学历毕业生。南京多所高校属于该范围，如南京大学、东南大学均为“双一流”建设高校，其所有专业毕业生一般可适用；其他高校若其特定专业属于“双一流”建设学科，相关专业毕业生也可受益。

2. 学历与学位要求：须为全日制本科及以上学历，并取得相应学位。成人教育、自考、网络教育等非全日制学生不在此列。

3. 就业要求：毕业生需与上海注册的用人单位签订劳动合同，且单位具备申报资格（一般要求注册资金达人民币100万元以上，并具备人事档案管理权限）。

4. 其他基本条件：无违法违纪记录，身体健康，能正常工作。

此外，若毕业生不符合“双一流”直接落户条件，仍可通过“非上海生源应届毕业生打分表”进行评分，达到72分（2023年标准）可申请落户，但竞争较激烈。

综上，南京“双一流”高校（如南大、东大）及其“双一流”学科的应届本科及以上毕业生，在上海落实合格用人单位后，可依政策直接申请落户，流程相对简便。建议关注上海市教委、人社局每年发布的最新政策细则，以获取准确信息。